3天冻胚和5天冻囊胚的区别在于，5天囊胚的移植着床成功率是要高于3天冻胚的，因为5天的冻囊胚比3天的胚胎在体外培养的时间多两天，且发育成囊胚的胚胎说明它自身的基因以及适应外界坏境的能力比3天冻胚更加优秀，此外囊胚移植更像是在模仿自然怀孕的规律，因此囊胚移植的着床成功率也相对更高一些。

在试管婴儿中，通常分为普通的冻胚移植或是冻囊胚移植，试管养囊和不养囊的区别在于移植成功率不同，在过去，我们只能移植培养1-3天的胚胎，而随着试管婴儿技术和实验室设备的迅速发展，试管婴儿技术可以做到将胚胎培养到第5-6天的囊胚阶段，从而提升试管成功率，通常3天冻胚与5天囊胚有以下区别：

1. 1. 培养时间有所不同，胚胎发育到第三天指的是卵裂期胚胎，囊胚通常是发育到5-7天的胚胎；
2. 2. 发育的能力有所差别，囊胚比普通冻胚在体外培养的时间要多2-3天，整体质量更佳；
3. 3. 着床率以及妊娠率不同，冻胚需要在宫腔中游离几天才能够着床到子宫内膜中，通常选择2个胚胎进行移植，而囊胚移植更加符合自然怀孕的着床时间，缩短了胚胎在子宫里面继续发育的时间，能够提高临床妊娠率和胚胎种植率，成功率相对较高一些。

3天冻胚移植和5天冻囊胚移植都有各自的好处，而着床成功率因人而异，不同身体素质的人会出现不同的效果，具体移植哪种胚胎还是要听从医生的建议，选择适合自己的胚胎移植便可。